W tym przypadku chodzi o przejście (prześwit) w miejscu, gdzie naturalnie go nie ma.
Zatem - jak się domyślam - pewnie pomiędzy przełykiem, a zewnętrzną powierzchnią szyi.
Inaczej mówiąc - przetoka to taki nienaturalny otwór, jakby dziura w ciele w miejscu, gdzie jej być nie powinno.
Więcej: http://pl.wikipedia.org/wiki/Przetoka